Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CftrP26361 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CftrP26361 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CftrP26361 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CftrP26361 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CftrP26361 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CftrP26361 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CftrP26361 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CftrP26361 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CftrP26361 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CftrP26361 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CftrP26361 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CftrP26361 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CftrP26361 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CftrP26361 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CftrP26361 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CftrP26361 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CftrP26361 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CftrP26361 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CftrP26361 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CftrP26361 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CftrP26361 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CftrP26361 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CftrP26361 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CftrP26361 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CftrP26361 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CftrP26361 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CftrP26361 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CftrP26361 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CftrP26361 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CftrP26361 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CftrP26361 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CftrP26361 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CftrP26361 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CftrP26361 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CftrP26361 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CftrP26361 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CftrP26361 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CftrP26361 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CftrP26361 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CftrP26361 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CftrP26361 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CftrP26361 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CftrP26361 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CftrP26361 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CftrP26361 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CftrP26361 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CftrP26361 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CftrP26361 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CftrP26361 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CftrP26361 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CftrP26361 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CftrP26361 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CftrP26361 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CftrP26361 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CftrP26361 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CftrP26361 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CftrP26361 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CftrP26361 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CftrP26361 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CftrP26361 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CftrP26361 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CftrP26361 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CftrP26361 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CftrP26361 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CftrP26361 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CftrP26361 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CftrP26361 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CftrP26361 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
CftrP26361 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CftrP26361 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CftrP26361 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CftrP26361 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CftrP26361 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CftrP26361 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CftrP26361 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CftrP26361 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CftrP26361 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CftrP26361 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CftrP26361 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CftrP26361 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CftrP26361 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CftrP26361 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CftrP26361 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CftrP26361 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CftrP26361 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CftrP26361 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CftrP26361 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CftrP26361 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CftrP26361 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CftrP26361 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CftrP26361 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CftrP26361 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CftrP26361 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CftrP26361 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CftrP26361 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CftrP26361 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CftrP26361 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CftrP26361 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CftrP26361 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms