Protein–RNA interactions for Protein: P26011

Itgb7, Integrin beta-7, mousemouse

Predictions only

Length 806 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb7P26011 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Itgb7P26011 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itgb7P26011 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itgb7P26011 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itgb7P26011 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itgb7P26011 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itgb7P26011 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms