Protein–RNA interactions for Protein: P23738

Hdc, Histidine decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HdcP23738 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HdcP23738 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HdcP23738 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
HdcP23738 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HdcP23738 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HdcP23738 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HdcP23738 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HdcP23738 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HdcP23738 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HdcP23738 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HdcP23738 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HdcP23738 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HdcP23738 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HdcP23738 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HdcP23738 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HdcP23738 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HdcP23738 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HdcP23738 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HdcP23738 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HdcP23738 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HdcP23738 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HdcP23738 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HdcP23738 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HdcP23738 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HdcP23738 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
HdcP23738 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HdcP23738 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HdcP23738 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
HdcP23738 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
HdcP23738 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HdcP23738 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HdcP23738 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HdcP23738 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HdcP23738 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HdcP23738 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HdcP23738 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HdcP23738 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HdcP23738 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HdcP23738 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
HdcP23738 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HdcP23738 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HdcP23738 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HdcP23738 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HdcP23738 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HdcP23738 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HdcP23738 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HdcP23738 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HdcP23738 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HdcP23738 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HdcP23738 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HdcP23738 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HdcP23738 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HdcP23738 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HdcP23738 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
HdcP23738 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HdcP23738 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
HdcP23738 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HdcP23738 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HdcP23738 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HdcP23738 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
HdcP23738 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HdcP23738 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
HdcP23738 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HdcP23738 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HdcP23738 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HdcP23738 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HdcP23738 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HdcP23738 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
HdcP23738 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HdcP23738 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HdcP23738 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HdcP23738 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HdcP23738 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HdcP23738 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HdcP23738 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HdcP23738 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HdcP23738 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HdcP23738 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HdcP23738 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HdcP23738 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HdcP23738 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
HdcP23738 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
HdcP23738 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
HdcP23738 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HdcP23738 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
HdcP23738 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
HdcP23738 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HdcP23738 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HdcP23738 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HdcP23738 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HdcP23738 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HdcP23738 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HdcP23738 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HdcP23738 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HdcP23738 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HdcP23738 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HdcP23738 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HdcP23738 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HdcP23738 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
HdcP23738 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms