Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkchP23298 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkchP23298 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkchP23298 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkchP23298 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkchP23298 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkchP23298 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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