Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PcnaP17918 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PcnaP17918 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PcnaP17918 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PcnaP17918 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PcnaP17918 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
PcnaP17918 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PcnaP17918 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PcnaP17918 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PcnaP17918 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PcnaP17918 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PcnaP17918 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PcnaP17918 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PcnaP17918 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PcnaP17918 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PcnaP17918 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PcnaP17918 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PcnaP17918 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PcnaP17918 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PcnaP17918 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PcnaP17918 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PcnaP17918 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PcnaP17918 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PcnaP17918 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PcnaP17918 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PcnaP17918 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PcnaP17918 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PcnaP17918 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PcnaP17918 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PcnaP17918 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PcnaP17918 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PcnaP17918 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PcnaP17918 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PcnaP17918 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PcnaP17918 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PcnaP17918 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PcnaP17918 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PcnaP17918 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PcnaP17918 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PcnaP17918 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PcnaP17918 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PcnaP17918 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PcnaP17918 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PcnaP17918 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PcnaP17918 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PcnaP17918 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PcnaP17918 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PcnaP17918 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PcnaP17918 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PcnaP17918 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PcnaP17918 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PcnaP17918 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PcnaP17918 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PcnaP17918 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PcnaP17918 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PcnaP17918 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PcnaP17918 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PcnaP17918 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PcnaP17918 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PcnaP17918 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PcnaP17918 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PcnaP17918 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PcnaP17918 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PcnaP17918 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PcnaP17918 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PcnaP17918 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PcnaP17918 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PcnaP17918 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PcnaP17918 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PcnaP17918 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PcnaP17918 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PcnaP17918 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PcnaP17918 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PcnaP17918 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PcnaP17918 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PcnaP17918 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PcnaP17918 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PcnaP17918 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PcnaP17918 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PcnaP17918 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PcnaP17918 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PcnaP17918 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PcnaP17918 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PcnaP17918 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PcnaP17918 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PcnaP17918 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PcnaP17918 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PcnaP17918 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PcnaP17918 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PcnaP17918 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PcnaP17918 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
PcnaP17918 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
PcnaP17918 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PcnaP17918 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PcnaP17918 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PcnaP17918 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PcnaP17918 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PcnaP17918 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PcnaP17918 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
PcnaP17918 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.1 ms