Protein–RNA interactions for Protein: P15533

Trim30a, Tripartite motif-containing protein 30A, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30aP15533 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim30aP15533 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms