Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

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Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Irf1P15314 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Gm13615-201ENSMUST00000120242 1612 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Irf1P15314 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Gm43339-201ENSMUST00000200032 1606 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irf1P15314 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Irf1P15314 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irf1P15314 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irf1P15314 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms