Protein–RNA interactions for Protein: P14733

Lmnb1, Lamin-B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb1P14733 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lmnb1P14733 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lmnb1P14733 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lmnb1P14733 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lmnb1P14733 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lmnb1P14733 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lmnb1P14733 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Lmnb1P14733 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Lmnb1P14733 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lmnb1P14733 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lmnb1P14733 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lmnb1P14733 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lmnb1P14733 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lmnb1P14733 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lmnb1P14733 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lmnb1P14733 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Lmnb1P14733 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Lmnb1P14733 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Lmnb1P14733 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lmnb1P14733 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lmnb1P14733 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lmnb1P14733 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lmnb1P14733 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lmnb1P14733 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lmnb1P14733 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lmnb1P14733 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lmnb1P14733 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lmnb1P14733 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lmnb1P14733 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Lmnb1P14733 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lmnb1P14733 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lmnb1P14733 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lmnb1P14733 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lmnb1P14733 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lmnb1P14733 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lmnb1P14733 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lmnb1P14733 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lmnb1P14733 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lmnb1P14733 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Lmnb1P14733 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lmnb1P14733 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lmnb1P14733 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lmnb1P14733 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Lmnb1P14733 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lmnb1P14733 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lmnb1P14733 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lmnb1P14733 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lmnb1P14733 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lmnb1P14733 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lmnb1P14733 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lmnb1P14733 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lmnb1P14733 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lmnb1P14733 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lmnb1P14733 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lmnb1P14733 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmnb1P14733 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmnb1P14733 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmnb1P14733 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmnb1P14733 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmnb1P14733 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmnb1P14733 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmnb1P14733 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmnb1P14733 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmnb1P14733 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmnb1P14733 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmnb1P14733 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmnb1P14733 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmnb1P14733 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmnb1P14733 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmnb1P14733 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmnb1P14733 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmnb1P14733 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmnb1P14733 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmnb1P14733 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmnb1P14733 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmnb1P14733 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmnb1P14733 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmnb1P14733 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmnb1P14733 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmnb1P14733 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmnb1P14733 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmnb1P14733 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmnb1P14733 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmnb1P14733 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmnb1P14733 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmnb1P14733 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmnb1P14733 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmnb1P14733 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmnb1P14733 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmnb1P14733 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmnb1P14733 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmnb1P14733 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmnb1P14733 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmnb1P14733 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmnb1P14733 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmnb1P14733 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmnb1P14733 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmnb1P14733 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmnb1P14733 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmnb1P14733 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms