Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms