Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms