Protein–RNA interactions for Protein: P12813

Nr4a1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a1P12813 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Nr4a1P12813 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Nr4a1P12813 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nr4a1P12813 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nr4a1P12813 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nr4a1P12813 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nr4a1P12813 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nr4a1P12813 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nr4a1P12813 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nr4a1P12813 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nr4a1P12813 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nr4a1P12813 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nr4a1P12813 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nr4a1P12813 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nr4a1P12813 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nr4a1P12813 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nr4a1P12813 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nr4a1P12813 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nr4a1P12813 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nr4a1P12813 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nr4a1P12813 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nr4a1P12813 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nr4a1P12813 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nr4a1P12813 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nr4a1P12813 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nr4a1P12813 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nr4a1P12813 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nr4a1P12813 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nr4a1P12813 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nr4a1P12813 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nr4a1P12813 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nr4a1P12813 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nr4a1P12813 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nr4a1P12813 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nr4a1P12813 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nr4a1P12813 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nr4a1P12813 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nr4a1P12813 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nr4a1P12813 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nr4a1P12813 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nr4a1P12813 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nr4a1P12813 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nr4a1P12813 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nr4a1P12813 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nr4a1P12813 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nr4a1P12813 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nr4a1P12813 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nr4a1P12813 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nr4a1P12813 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nr4a1P12813 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nr4a1P12813 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nr4a1P12813 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nr4a1P12813 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nr4a1P12813 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nr4a1P12813 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nr4a1P12813 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nr4a1P12813 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nr4a1P12813 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nr4a1P12813 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nr4a1P12813 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nr4a1P12813 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nr4a1P12813 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Nr4a1P12813 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nr4a1P12813 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nr4a1P12813 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nr4a1P12813 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nr4a1P12813 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nr4a1P12813 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nr4a1P12813 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nr4a1P12813 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nr4a1P12813 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nr4a1P12813 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nr4a1P12813 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nr4a1P12813 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nr4a1P12813 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nr4a1P12813 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nr4a1P12813 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nr4a1P12813 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nr4a1P12813 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nr4a1P12813 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nr4a1P12813 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nr4a1P12813 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nr4a1P12813 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nr4a1P12813 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nr4a1P12813 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Nr4a1P12813 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nr4a1P12813 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nr4a1P12813 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nr4a1P12813 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nr4a1P12813 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nr4a1P12813 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nr4a1P12813 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nr4a1P12813 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Nr4a1P12813 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Nr4a1P12813 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nr4a1P12813 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nr4a1P12813 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nr4a1P12813 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nr4a1P12813 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nr4a1P12813 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms