Protein–RNA interactions for Protein: P10400

Pol, Retrovirus-related Pol polyprotein (Fragment), mousemouse

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Length 120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP10400 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PolP10400 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PolP10400 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PolP10400 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PolP10400 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PolP10400 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
PolP10400 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PolP10400 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PolP10400 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PolP10400 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PolP10400 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PolP10400 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PolP10400 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
PolP10400 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PolP10400 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PolP10400 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PolP10400 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
PolP10400 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PolP10400 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PolP10400 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
PolP10400 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
PolP10400 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
PolP10400 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
PolP10400 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
PolP10400 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
PolP10400 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
PolP10400 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
PolP10400 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
PolP10400 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PolP10400 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PolP10400 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PolP10400 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PolP10400 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PolP10400 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PolP10400 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PolP10400 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PolP10400 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PolP10400 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PolP10400 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PolP10400 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PolP10400 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
PolP10400 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
PolP10400 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PolP10400 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
PolP10400 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PolP10400 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
PolP10400 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PolP10400 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PolP10400 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PolP10400 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PolP10400 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PolP10400 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PolP10400 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PolP10400 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PolP10400 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PolP10400 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PolP10400 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PolP10400 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PolP10400 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PolP10400 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PolP10400 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PolP10400 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PolP10400 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PolP10400 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PolP10400 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PolP10400 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PolP10400 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PolP10400 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PolP10400 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PolP10400 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PolP10400 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PolP10400 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PolP10400 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
PolP10400 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PolP10400 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PolP10400 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PolP10400 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PolP10400 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PolP10400 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PolP10400 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PolP10400 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PolP10400 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PolP10400 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PolP10400 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PolP10400 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PolP10400 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
PolP10400 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
PolP10400 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
PolP10400 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PolP10400 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PolP10400 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PolP10400 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PolP10400 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PolP10400 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PolP10400 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PolP10400 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PolP10400 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PolP10400 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PolP10400 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PolP10400 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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