Protein–RNA interactions for Protein: P10085

Myod1, Myoblast determination protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myod1P10085 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Myod1P10085 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Myod1P10085 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Myod1P10085 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Myod1P10085 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Myod1P10085 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Myod1P10085 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Myod1P10085 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Myod1P10085 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Myod1P10085 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Myod1P10085 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Myod1P10085 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Myod1P10085 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Myod1P10085 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Myod1P10085 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Myod1P10085 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Myod1P10085 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Myod1P10085 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Myod1P10085 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Myod1P10085 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Myod1P10085 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Myod1P10085 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Myod1P10085 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Myod1P10085 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Myod1P10085 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Myod1P10085 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Myod1P10085 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Myod1P10085 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Myod1P10085 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Myod1P10085 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Myod1P10085 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Myod1P10085 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Myod1P10085 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Myod1P10085 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Myod1P10085 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Myod1P10085 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Myod1P10085 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Myod1P10085 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Myod1P10085 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Myod1P10085 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Myod1P10085 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Myod1P10085 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Myod1P10085 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Myod1P10085 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Myod1P10085 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Myod1P10085 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Myod1P10085 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Myod1P10085 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Myod1P10085 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Myod1P10085 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Myod1P10085 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Myod1P10085 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Myod1P10085 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Myod1P10085 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Myod1P10085 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Myod1P10085 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Myod1P10085 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Myod1P10085 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Myod1P10085 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Myod1P10085 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Myod1P10085 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Myod1P10085 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Myod1P10085 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Myod1P10085 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Myod1P10085 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Myod1P10085 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Myod1P10085 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Myod1P10085 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Myod1P10085 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Myod1P10085 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Myod1P10085 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Myod1P10085 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Myod1P10085 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Myod1P10085 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Myod1P10085 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Myod1P10085 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Myod1P10085 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Myod1P10085 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Myod1P10085 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Myod1P10085 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Myod1P10085 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Myod1P10085 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Myod1P10085 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Myod1P10085 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Myod1P10085 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Myod1P10085 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Myod1P10085 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Myod1P10085 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Myod1P10085 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Myod1P10085 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Myod1P10085 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Myod1P10085 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Myod1P10085 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Myod1P10085 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Myod1P10085 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Myod1P10085 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Myod1P10085 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Myod1P10085 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Myod1P10085 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Myod1P10085 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms