Protein–RNA interactions for Protein: P09925

Surf1, Surfeit locus protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf1P09925 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Surf1P09925 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Surf1P09925 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Surf1P09925 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Surf1P09925 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Surf1P09925 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Surf1P09925 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Surf1P09925 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Surf1P09925 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Surf1P09925 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Surf1P09925 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Surf1P09925 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Surf1P09925 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Surf1P09925 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Surf1P09925 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Surf1P09925 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Surf1P09925 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Surf1P09925 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Surf1P09925 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Surf1P09925 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Surf1P09925 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Surf1P09925 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Surf1P09925 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Surf1P09925 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Surf1P09925 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Surf1P09925 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Surf1P09925 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Surf1P09925 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Surf1P09925 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Surf1P09925 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Surf1P09925 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Surf1P09925 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Surf1P09925 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Surf1P09925 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Surf1P09925 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Surf1P09925 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Surf1P09925 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Surf1P09925 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Surf1P09925 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Surf1P09925 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Surf1P09925 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Surf1P09925 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Surf1P09925 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Surf1P09925 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Surf1P09925 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Surf1P09925 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Surf1P09925 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Surf1P09925 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Surf1P09925 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Surf1P09925 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Surf1P09925 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Surf1P09925 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Surf1P09925 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Surf1P09925 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Surf1P09925 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Surf1P09925 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Surf1P09925 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Surf1P09925 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Surf1P09925 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Surf1P09925 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Surf1P09925 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Surf1P09925 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Surf1P09925 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Surf1P09925 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Surf1P09925 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Surf1P09925 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Surf1P09925 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Surf1P09925 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Surf1P09925 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Surf1P09925 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Surf1P09925 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Surf1P09925 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Surf1P09925 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Surf1P09925 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Surf1P09925 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Surf1P09925 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Surf1P09925 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Surf1P09925 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Surf1P09925 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Surf1P09925 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Surf1P09925 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Surf1P09925 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Surf1P09925 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Surf1P09925 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Surf1P09925 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Surf1P09925 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Surf1P09925 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Surf1P09925 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Surf1P09925 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Surf1P09925 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Surf1P09925 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Surf1P09925 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Surf1P09925 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Surf1P09925 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Surf1P09925 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Surf1P09925 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Surf1P09925 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Surf1P09925 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Surf1P09925 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Surf1P09925 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms