Protein–RNA interactions for Protein: P08122

Col4a2, Collagen alpha-2(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a2P08122 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col4a2P08122 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms