Protein–RNA interactions for Protein: P01678

Ig kappa chain V-VI region SAPC 10, mousemouse

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01678 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01678 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
P01678 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01678 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01678 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01678 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01678 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01678 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01678 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01678 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01678 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01678 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01678 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01678 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01678 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01678 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01678 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01678 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01678 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01678 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01678 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01678 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01678 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01678 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01678 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01678 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01678 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01678 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
P01678 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01678 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01678 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01678 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01678 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01678 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01678 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01678 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01678 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P01678 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
P01678 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P01678 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P01678 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
P01678 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
P01678 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01678 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01678 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01678 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01678 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
P01678 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01678 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01678 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01678 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01678 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01678 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01678 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01678 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01678 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01678 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01678 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01678 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01678 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01678 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01678 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01678 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
P01678 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01678 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
P01678 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01678 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01678 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01678 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01678 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01678 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01678 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01678 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01678 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01678 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01678 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01678 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01678 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01678 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01678 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01678 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01678 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01678 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01678 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01678 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01678 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01678 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01678 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01678 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01678 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
P01678 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01678 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01678 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01678 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
P01678 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01678 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01678 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01678 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01678 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01678 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms