Protein–RNA interactions for Protein: P01667

Ig kappa chain V-III region PC 6308, mousemouse

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01667 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01667 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01667 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
P01667 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01667 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01667 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01667 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
P01667 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
P01667 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01667 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
P01667 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01667 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
P01667 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01667 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
P01667 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01667 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01667 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01667 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01667 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01667 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01667 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01667 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01667 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01667 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01667 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01667 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01667 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01667 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01667 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01667 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01667 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01667 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01667 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01667 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01667 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01667 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
P01667 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01667 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01667 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01667 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01667 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01667 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01667 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01667 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01667 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01667 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01667 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
P01667 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01667 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
P01667 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01667 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01667 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01667 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01667 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01667 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
P01667 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
P01667 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01667 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01667 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01667 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01667 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01667 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01667 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01667 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01667 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01667 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01667 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01667 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01667 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01667 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01667 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
P01667 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
P01667 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
P01667 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
P01667 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
P01667 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
P01667 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
P01667 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
P01667 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
P01667 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
P01667 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
P01667 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
P01667 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P01667 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
P01667 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
P01667 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
P01667 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
P01667 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
P01667 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
P01667 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
P01667 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
P01667 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
P01667 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P01667 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P01667 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
P01667 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P01667 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
P01667 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P01667 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
P01667 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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