Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SlkO54988 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SlkO54988 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SlkO54988 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SlkO54988 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SlkO54988 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SlkO54988 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SlkO54988 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SlkO54988 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SlkO54988 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SlkO54988 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SlkO54988 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SlkO54988 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SlkO54988 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SlkO54988 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SlkO54988 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SlkO54988 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SlkO54988 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SlkO54988 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SlkO54988 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SlkO54988 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SlkO54988 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SlkO54988 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SlkO54988 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SlkO54988 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SlkO54988 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SlkO54988 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SlkO54988 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SlkO54988 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SlkO54988 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SlkO54988 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SlkO54988 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SlkO54988 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SlkO54988 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SlkO54988 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SlkO54988 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SlkO54988 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SlkO54988 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SlkO54988 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SlkO54988 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SlkO54988 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SlkO54988 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SlkO54988 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SlkO54988 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SlkO54988 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SlkO54988 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SlkO54988 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SlkO54988 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SlkO54988 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SlkO54988 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SlkO54988 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SlkO54988 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SlkO54988 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SlkO54988 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SlkO54988 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SlkO54988 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SlkO54988 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SlkO54988 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SlkO54988 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SlkO54988 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SlkO54988 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SlkO54988 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SlkO54988 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SlkO54988 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SlkO54988 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SlkO54988 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SlkO54988 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SlkO54988 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SlkO54988 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SlkO54988 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SlkO54988 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SlkO54988 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SlkO54988 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SlkO54988 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SlkO54988 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SlkO54988 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SlkO54988 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SlkO54988 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SlkO54988 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SlkO54988 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SlkO54988 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SlkO54988 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SlkO54988 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SlkO54988 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SlkO54988 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SlkO54988 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SlkO54988 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SlkO54988 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SlkO54988 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SlkO54988 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SlkO54988 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SlkO54988 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SlkO54988 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SlkO54988 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SlkO54988 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SlkO54988 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SlkO54988 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SlkO54988 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SlkO54988 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SlkO54988 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms