Protein–RNA interactions for Protein: O54942

Cldn5, Claudin-5, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn5O54942 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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