Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
DffaO54786 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
DffaO54786 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
DffaO54786 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
DffaO54786 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
DffaO54786 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
DffaO54786 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
DffaO54786 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
DffaO54786 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
DffaO54786 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
DffaO54786 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
DffaO54786 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
DffaO54786 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
DffaO54786 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
DffaO54786 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
DffaO54786 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
DffaO54786 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
DffaO54786 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
DffaO54786 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
DffaO54786 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DffaO54786 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DffaO54786 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DffaO54786 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
DffaO54786 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DffaO54786 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
DffaO54786 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DffaO54786 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DffaO54786 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DffaO54786 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DffaO54786 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DffaO54786 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DffaO54786 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
DffaO54786 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
DffaO54786 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DffaO54786 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DffaO54786 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
DffaO54786 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DffaO54786 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DffaO54786 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
DffaO54786 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DffaO54786 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DffaO54786 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DffaO54786 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DffaO54786 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DffaO54786 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
DffaO54786 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
DffaO54786 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
DffaO54786 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
DffaO54786 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
DffaO54786 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
DffaO54786 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
DffaO54786 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
DffaO54786 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
DffaO54786 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
DffaO54786 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
DffaO54786 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
DffaO54786 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
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DffaO54786 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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DffaO54786 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
DffaO54786 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DffaO54786 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DffaO54786 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DffaO54786 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DffaO54786 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DffaO54786 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DffaO54786 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
DffaO54786 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DffaO54786 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DffaO54786 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DffaO54786 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
DffaO54786 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DffaO54786 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DffaO54786 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DffaO54786 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DffaO54786 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DffaO54786 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
DffaO54786 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DffaO54786 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DffaO54786 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DffaO54786 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DffaO54786 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DffaO54786 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DffaO54786 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DffaO54786 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DffaO54786 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
DffaO54786 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
DffaO54786 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DffaO54786 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DffaO54786 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DffaO54786 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DffaO54786 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DffaO54786 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DffaO54786 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DffaO54786 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DffaO54786 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DffaO54786 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DffaO54786 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DffaO54786 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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