Protein–RNA interactions for Protein: O35963

Rab33b, Ras-related protein Rab-33B, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab33bO35963 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rab33bO35963 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms