Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
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Opn1mwO35599 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
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Opn1mwO35599 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
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Opn1mwO35599 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Opn1mwO35599 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Opn1mwO35599 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Opn1mwO35599 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Opn1mwO35599 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Opn1mwO35599 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Opn1mwO35599 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Opn1mwO35599 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Opn1mwO35599 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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