Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Polr1aO35134 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Polr1aO35134 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Polr1aO35134 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Polr1aO35134 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Polr1aO35134 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Polr1aO35134 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Polr1aO35134 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Polr1aO35134 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Polr1aO35134 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Polr1aO35134 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Polr1aO35134 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Polr1aO35134 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Polr1aO35134 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Polr1aO35134 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Polr1aO35134 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Polr1aO35134 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Polr1aO35134 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Polr1aO35134 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Polr1aO35134 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Polr1aO35134 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Polr1aO35134 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Polr1aO35134 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Polr1aO35134 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Polr1aO35134 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Polr1aO35134 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Polr1aO35134 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Polr1aO35134 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Polr1aO35134 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Polr1aO35134 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Polr1aO35134 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Polr1aO35134 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Polr1aO35134 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Polr1aO35134 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Polr1aO35134 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Polr1aO35134 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Polr1aO35134 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Polr1aO35134 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Polr1aO35134 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Polr1aO35134 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Polr1aO35134 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Polr1aO35134 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Polr1aO35134 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Polr1aO35134 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Polr1aO35134 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Polr1aO35134 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Polr1aO35134 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Polr1aO35134 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Polr1aO35134 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Polr1aO35134 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Polr1aO35134 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Polr1aO35134 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Polr1aO35134 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Polr1aO35134 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Polr1aO35134 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Polr1aO35134 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Polr1aO35134 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Polr1aO35134 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Polr1aO35134 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Polr1aO35134 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Polr1aO35134 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Polr1aO35134 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Polr1aO35134 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Polr1aO35134 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Polr1aO35134 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Polr1aO35134 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Polr1aO35134 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Polr1aO35134 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Polr1aO35134 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Polr1aO35134 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Polr1aO35134 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Polr1aO35134 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Polr1aO35134 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Polr1aO35134 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Polr1aO35134 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Polr1aO35134 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Polr1aO35134 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Polr1aO35134 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Polr1aO35134 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Polr1aO35134 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Polr1aO35134 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Polr1aO35134 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Polr1aO35134 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Polr1aO35134 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Polr1aO35134 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Polr1aO35134 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Polr1aO35134 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Polr1aO35134 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Polr1aO35134 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Polr1aO35134 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Polr1aO35134 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Polr1aO35134 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Polr1aO35134 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Polr1aO35134 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Polr1aO35134 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Polr1aO35134 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Polr1aO35134 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Polr1aO35134 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Polr1aO35134 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Polr1aO35134 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms