Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 2900076G11Rik-201ENSMUST00000202297 631 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ArxO35085 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ArxO35085 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ArxO35085 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ArxO35085 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ArxO35085 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ArxO35085 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ArxO35085 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ArxO35085 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ArxO35085 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ArxO35085 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ArxO35085 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ArxO35085 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ArxO35085 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ArxO35085 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ArxO35085 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ArxO35085 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ArxO35085 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ArxO35085 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ArxO35085 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ArxO35085 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ArxO35085 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ArxO35085 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ArxO35085 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ArxO35085 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ArxO35085 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ArxO35085 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ArxO35085 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ArxO35085 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ArxO35085 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ArxO35085 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ArxO35085 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ArxO35085 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ArxO35085 Gm43339-201ENSMUST00000200032 1606 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ArxO35085 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ArxO35085 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ArxO35085 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ArxO35085 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ArxO35085 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ArxO35085 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ArxO35085 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ArxO35085 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ArxO35085 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ArxO35085 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ArxO35085 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ArxO35085 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ArxO35085 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ArxO35085 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ArxO35085 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ArxO35085 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ArxO35085 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ArxO35085 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ArxO35085 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ArxO35085 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ArxO35085 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ArxO35085 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ArxO35085 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ArxO35085 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ArxO35085 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ArxO35085 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ArxO35085 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ArxO35085 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ArxO35085 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
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ArxO35085 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ArxO35085 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ArxO35085 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
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ArxO35085 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ArxO35085 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ArxO35085 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ArxO35085 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ArxO35085 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ArxO35085 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ArxO35085 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ArxO35085 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ArxO35085 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ArxO35085 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ArxO35085 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ArxO35085 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ArxO35085 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ArxO35085 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ArxO35085 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ArxO35085 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ArxO35085 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ArxO35085 Gm20089-201ENSMUST00000192391 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ArxO35085 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ArxO35085 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ArxO35085 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ArxO35085 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ArxO35085 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ArxO35085 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ArxO35085 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ArxO35085 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ArxO35085 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ArxO35085 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ArxO35085 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ArxO35085 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ArxO35085 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ArxO35085 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms