Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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H2-Q1O19441 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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H2-Q1O19441 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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H2-Q1O19441 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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H2-Q1O19441 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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H2-Q1O19441 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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H2-Q1O19441 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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H2-Q1O19441 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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H2-Q1O19441 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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H2-Q1O19441 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-Q1O19441 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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