Protein–RNA interactions for Protein: O08983

Hps1, Hermansky-Pudlak syndrome 1 protein homolog, mousemouse

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Length 704 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps1O08983 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hps1O08983 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hps1O08983 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hps1O08983 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hps1O08983 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hps1O08983 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hps1O08983 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hps1O08983 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hps1O08983 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hps1O08983 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hps1O08983 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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