Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sec22bO08547 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sec22bO08547 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sec22bO08547 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sec22bO08547 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sec22bO08547 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sec22bO08547 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sec22bO08547 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sec22bO08547 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sec22bO08547 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sec22bO08547 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sec22bO08547 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sec22bO08547 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Sec22bO08547 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Sec22bO08547 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sec22bO08547 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sec22bO08547 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sec22bO08547 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sec22bO08547 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sec22bO08547 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sec22bO08547 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sec22bO08547 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sec22bO08547 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sec22bO08547 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sec22bO08547 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Sec22bO08547 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Sec22bO08547 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sec22bO08547 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sec22bO08547 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sec22bO08547 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sec22bO08547 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sec22bO08547 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sec22bO08547 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sec22bO08547 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sec22bO08547 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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