Protein–RNA interactions for Protein: O08543

Efna5, Ephrin-A5, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna5O08543 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Efna5O08543 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Efna5O08543 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Efna5O08543 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Efna5O08543 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Efna5O08543 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Efna5O08543 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Efna5O08543 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Efna5O08543 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Efna5O08543 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Efna5O08543 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Efna5O08543 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Efna5O08543 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Efna5O08543 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Efna5O08543 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Efna5O08543 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Efna5O08543 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Efna5O08543 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Efna5O08543 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Efna5O08543 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Efna5O08543 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Efna5O08543 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Efna5O08543 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Efna5O08543 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Efna5O08543 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Efna5O08543 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Efna5O08543 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Efna5O08543 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Efna5O08543 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Efna5O08543 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Efna5O08543 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Efna5O08543 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Efna5O08543 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Efna5O08543 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Efna5O08543 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Efna5O08543 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Efna5O08543 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Efna5O08543 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Efna5O08543 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Efna5O08543 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Efna5O08543 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Efna5O08543 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Efna5O08543 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Efna5O08543 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Efna5O08543 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Efna5O08543 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Efna5O08543 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Efna5O08543 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Efna5O08543 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Efna5O08543 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Efna5O08543 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Efna5O08543 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Efna5O08543 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Efna5O08543 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Efna5O08543 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Efna5O08543 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Efna5O08543 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efna5O08543 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Efna5O08543 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.5 ms