Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms