Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc180J3QNE4 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc180J3QNE4 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc180J3QNE4 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc180J3QNE4 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc180J3QNE4 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc180J3QNE4 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc180J3QNE4 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc180J3QNE4 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc180J3QNE4 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc180J3QNE4 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc180J3QNE4 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc180J3QNE4 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms