Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms