Protein–RNA interactions for Protein: J3QMY9

Top6bl, Type 2 DNA topoisomerase 6 subunit B-like, mousemouse

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top6blJ3QMY9 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Top6blJ3QMY9 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Top6blJ3QMY9 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Top6blJ3QMY9 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Top6blJ3QMY9 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Top6blJ3QMY9 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Top6blJ3QMY9 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Top6blJ3QMY9 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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