Protein–RNA interactions for Protein: J3QME6

Lipo1, Lipase, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lipo1J3QME6 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lipo1J3QME6 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lipo1J3QME6 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lipo1J3QME6 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lipo1J3QME6 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Lipo1J3QME6 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lipo1J3QME6 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lipo1J3QME6 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lipo1J3QME6 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lipo1J3QME6 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lipo1J3QME6 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lipo1J3QME6 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lipo1J3QME6 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lipo1J3QME6 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lipo1J3QME6 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lipo1J3QME6 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lipo1J3QME6 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lipo1J3QME6 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lipo1J3QME6 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lipo1J3QME6 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lipo1J3QME6 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lipo1J3QME6 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lipo1J3QME6 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lipo1J3QME6 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lipo1J3QME6 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lipo1J3QME6 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lipo1J3QME6 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lipo1J3QME6 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lipo1J3QME6 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Lipo1J3QME6 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lipo1J3QME6 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lipo1J3QME6 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lipo1J3QME6 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Lipo1J3QME6 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Lipo1J3QME6 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Lipo1J3QME6 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lipo1J3QME6 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lipo1J3QME6 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Lipo1J3QME6 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lipo1J3QME6 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lipo1J3QME6 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lipo1J3QME6 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lipo1J3QME6 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lipo1J3QME6 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lipo1J3QME6 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lipo1J3QME6 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lipo1J3QME6 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Lipo1J3QME6 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lipo1J3QME6 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lipo1J3QME6 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lipo1J3QME6 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Lipo1J3QME6 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lipo1J3QME6 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lipo1J3QME6 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Lipo1J3QME6 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lipo1J3QME6 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lipo1J3QME6 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lipo1J3QME6 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lipo1J3QME6 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lipo1J3QME6 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lipo1J3QME6 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lipo1J3QME6 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lipo1J3QME6 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lipo1J3QME6 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lipo1J3QME6 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lipo1J3QME6 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lipo1J3QME6 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lipo1J3QME6 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Lipo1J3QME6 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lipo1J3QME6 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lipo1J3QME6 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lipo1J3QME6 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lipo1J3QME6 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lipo1J3QME6 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lipo1J3QME6 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lipo1J3QME6 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lipo1J3QME6 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lipo1J3QME6 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lipo1J3QME6 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lipo1J3QME6 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lipo1J3QME6 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lipo1J3QME6 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lipo1J3QME6 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lipo1J3QME6 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lipo1J3QME6 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lipo1J3QME6 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lipo1J3QME6 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lipo1J3QME6 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lipo1J3QME6 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lipo1J3QME6 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lipo1J3QME6 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lipo1J3QME6 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lipo1J3QME6 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lipo1J3QME6 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lipo1J3QME6 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Lipo1J3QME6 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lipo1J3QME6 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lipo1J3QME6 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Lipo1J3QME6 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lipo1J3QME6 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms