Protein–RNA interactions for Protein: J3QK56

4930544D05Rik, RIKEN cDNA 4930544D05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544D05RikJ3QK56 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930544D05RikJ3QK56 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
4930544D05RikJ3QK56 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.07■□□□□ 0
4930544D05RikJ3QK56 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
4930544D05RikJ3QK56 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
4930544D05RikJ3QK56 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930544D05RikJ3QK56 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930544D05RikJ3QK56 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930544D05RikJ3QK56 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
4930544D05RikJ3QK56 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.07■□□□□ 0
4930544D05RikJ3QK56 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
4930544D05RikJ3QK56 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
4930544D05RikJ3QK56 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
4930544D05RikJ3QK56 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
4930544D05RikJ3QK56 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930544D05RikJ3QK56 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930544D05RikJ3QK56 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930544D05RikJ3QK56 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
4930544D05RikJ3QK56 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930544D05RikJ3QK56 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930544D05RikJ3QK56 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930544D05RikJ3QK56 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.07■□□□□ 0
4930544D05RikJ3QK56 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
4930544D05RikJ3QK56 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930544D05RikJ3QK56 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930544D05RikJ3QK56 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930544D05RikJ3QK56 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
4930544D05RikJ3QK56 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
4930544D05RikJ3QK56 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
4930544D05RikJ3QK56 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4930544D05RikJ3QK56 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.06■□□□□ 0
4930544D05RikJ3QK56 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4930544D05RikJ3QK56 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4930544D05RikJ3QK56 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4930544D05RikJ3QK56 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4930544D05RikJ3QK56 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4930544D05RikJ3QK56 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4930544D05RikJ3QK56 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.06■□□□□ 0
4930544D05RikJ3QK56 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.06■□□□□ 0
4930544D05RikJ3QK56 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.06■□□□□ 0
4930544D05RikJ3QK56 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
4930544D05RikJ3QK56 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
4930544D05RikJ3QK56 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.06■□□□□ 0
4930544D05RikJ3QK56 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.06■□□□□ 0
4930544D05RikJ3QK56 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.06■□□□□ 0
4930544D05RikJ3QK56 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4930544D05RikJ3QK56 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.06■□□□□ 0
4930544D05RikJ3QK56 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4930544D05RikJ3QK56 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4930544D05RikJ3QK56 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4930544D05RikJ3QK56 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4930544D05RikJ3QK56 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4930544D05RikJ3QK56 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4930544D05RikJ3QK56 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
4930544D05RikJ3QK56 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4930544D05RikJ3QK56 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4930544D05RikJ3QK56 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
4930544D05RikJ3QK56 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4930544D05RikJ3QK56 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
4930544D05RikJ3QK56 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4930544D05RikJ3QK56 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
4930544D05RikJ3QK56 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
4930544D05RikJ3QK56 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
4930544D05RikJ3QK56 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
4930544D05RikJ3QK56 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
4930544D05RikJ3QK56 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
4930544D05RikJ3QK56 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
4930544D05RikJ3QK56 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
4930544D05RikJ3QK56 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4930544D05RikJ3QK56 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4930544D05RikJ3QK56 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4930544D05RikJ3QK56 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4930544D05RikJ3QK56 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
4930544D05RikJ3QK56 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4930544D05RikJ3QK56 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4930544D05RikJ3QK56 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4930544D05RikJ3QK56 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4930544D05RikJ3QK56 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.05■□□□□ -0
4930544D05RikJ3QK56 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.05■□□□□ -0
4930544D05RikJ3QK56 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
4930544D05RikJ3QK56 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4930544D05RikJ3QK56 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4930544D05RikJ3QK56 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4930544D05RikJ3QK56 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
4930544D05RikJ3QK56 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4930544D05RikJ3QK56 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4930544D05RikJ3QK56 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4930544D05RikJ3QK56 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.05■□□□□ -0
4930544D05RikJ3QK56 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4930544D05RikJ3QK56 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4930544D05RikJ3QK56 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4930544D05RikJ3QK56 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
4930544D05RikJ3QK56 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.04■□□□□ -0
4930544D05RikJ3QK56 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930544D05RikJ3QK56 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930544D05RikJ3QK56 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930544D05RikJ3QK56 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930544D05RikJ3QK56 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.04■□□□□ -0
4930544D05RikJ3QK56 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930544D05RikJ3QK56 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms