Protein–RNA interactions for Protein: J3KMR8

Gm17535, Predicted gene, 17535, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17535J3KMR8 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm17535J3KMR8 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm17535J3KMR8 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm17535J3KMR8 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm17535J3KMR8 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm17535J3KMR8 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm17535J3KMR8 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms