Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Gm28048F7BCN0 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Gm28048F7BCN0 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
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Gm28048F7BCN0 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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