Protein–RNA interactions for Protein: F6U8B9

Gm17555, Predicted gene, 17555, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17555F6U8B9 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Gm17555F6U8B9 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Gm17555F6U8B9 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Gm17555F6U8B9 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Gm17555F6U8B9 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Gm17555F6U8B9 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Gm17555F6U8B9 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Gm17555F6U8B9 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Gm17555F6U8B9 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Gm17555F6U8B9 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Gm17555F6U8B9 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm17555F6U8B9 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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