Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syngap1F6SEU4 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms