Protein–RNA interactions for Protein: F6RXI4

BC067074, cDNA sequence BC067074, mousemouse

Predictions only

Length 2,391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC067074F6RXI4 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC067074F6RXI4 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC067074F6RXI4 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC067074F6RXI4 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC067074F6RXI4 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC067074F6RXI4 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC067074F6RXI4 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC067074F6RXI4 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC067074F6RXI4 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC067074F6RXI4 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC067074F6RXI4 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC067074F6RXI4 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC067074F6RXI4 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC067074F6RXI4 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC067074F6RXI4 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC067074F6RXI4 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC067074F6RXI4 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC067074F6RXI4 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC067074F6RXI4 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC067074F6RXI4 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
BC067074F6RXI4 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC067074F6RXI4 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC067074F6RXI4 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC067074F6RXI4 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
BC067074F6RXI4 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
BC067074F6RXI4 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
BC067074F6RXI4 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC067074F6RXI4 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC067074F6RXI4 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC067074F6RXI4 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC067074F6RXI4 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC067074F6RXI4 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC067074F6RXI4 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC067074F6RXI4 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC067074F6RXI4 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC067074F6RXI4 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC067074F6RXI4 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC067074F6RXI4 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC067074F6RXI4 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC067074F6RXI4 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC067074F6RXI4 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC067074F6RXI4 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC067074F6RXI4 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC067074F6RXI4 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC067074F6RXI4 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC067074F6RXI4 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC067074F6RXI4 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC067074F6RXI4 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC067074F6RXI4 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC067074F6RXI4 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC067074F6RXI4 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
BC067074F6RXI4 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC067074F6RXI4 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC067074F6RXI4 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
BC067074F6RXI4 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC067074F6RXI4 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC067074F6RXI4 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC067074F6RXI4 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC067074F6RXI4 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC067074F6RXI4 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC067074F6RXI4 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC067074F6RXI4 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC067074F6RXI4 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC067074F6RXI4 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC067074F6RXI4 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC067074F6RXI4 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC067074F6RXI4 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC067074F6RXI4 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC067074F6RXI4 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC067074F6RXI4 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC067074F6RXI4 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC067074F6RXI4 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC067074F6RXI4 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC067074F6RXI4 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC067074F6RXI4 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC067074F6RXI4 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC067074F6RXI4 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC067074F6RXI4 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC067074F6RXI4 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC067074F6RXI4 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC067074F6RXI4 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC067074F6RXI4 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC067074F6RXI4 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC067074F6RXI4 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC067074F6RXI4 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC067074F6RXI4 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC067074F6RXI4 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC067074F6RXI4 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC067074F6RXI4 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
BC067074F6RXI4 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC067074F6RXI4 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC067074F6RXI4 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
BC067074F6RXI4 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
BC067074F6RXI4 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
BC067074F6RXI4 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
BC067074F6RXI4 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
BC067074F6RXI4 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
BC067074F6RXI4 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
BC067074F6RXI4 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
BC067074F6RXI4 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
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