Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Urb2E9Q7L1 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Urb2E9Q7L1 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Urb2E9Q7L1 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Urb2E9Q7L1 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Urb2E9Q7L1 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Urb2E9Q7L1 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Urb2E9Q7L1 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Urb2E9Q7L1 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Urb2E9Q7L1 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Urb2E9Q7L1 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Urb2E9Q7L1 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Urb2E9Q7L1 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Urb2E9Q7L1 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Urb2E9Q7L1 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Urb2E9Q7L1 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Urb2E9Q7L1 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Urb2E9Q7L1 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Urb2E9Q7L1 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Urb2E9Q7L1 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Urb2E9Q7L1 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Urb2E9Q7L1 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Urb2E9Q7L1 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Urb2E9Q7L1 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Urb2E9Q7L1 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Urb2E9Q7L1 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Urb2E9Q7L1 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Urb2E9Q7L1 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Urb2E9Q7L1 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Urb2E9Q7L1 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Urb2E9Q7L1 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Urb2E9Q7L1 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Urb2E9Q7L1 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Urb2E9Q7L1 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Urb2E9Q7L1 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Urb2E9Q7L1 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Urb2E9Q7L1 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Urb2E9Q7L1 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Urb2E9Q7L1 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Urb2E9Q7L1 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Urb2E9Q7L1 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Urb2E9Q7L1 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Urb2E9Q7L1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Urb2E9Q7L1 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Urb2E9Q7L1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Urb2E9Q7L1 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Urb2E9Q7L1 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Urb2E9Q7L1 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Urb2E9Q7L1 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Urb2E9Q7L1 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Urb2E9Q7L1 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Urb2E9Q7L1 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Urb2E9Q7L1 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Urb2E9Q7L1 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Urb2E9Q7L1 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Urb2E9Q7L1 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Urb2E9Q7L1 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Urb2E9Q7L1 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Urb2E9Q7L1 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Urb2E9Q7L1 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Urb2E9Q7L1 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Urb2E9Q7L1 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Urb2E9Q7L1 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Urb2E9Q7L1 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Urb2E9Q7L1 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Urb2E9Q7L1 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Urb2E9Q7L1 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Urb2E9Q7L1 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Urb2E9Q7L1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Urb2E9Q7L1 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Urb2E9Q7L1 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Urb2E9Q7L1 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Urb2E9Q7L1 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Urb2E9Q7L1 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Urb2E9Q7L1 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Urb2E9Q7L1 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Urb2E9Q7L1 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Urb2E9Q7L1 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Urb2E9Q7L1 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Urb2E9Q7L1 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Urb2E9Q7L1 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Urb2E9Q7L1 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Urb2E9Q7L1 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Urb2E9Q7L1 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Urb2E9Q7L1 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Urb2E9Q7L1 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Urb2E9Q7L1 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Urb2E9Q7L1 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Urb2E9Q7L1 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Urb2E9Q7L1 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Urb2E9Q7L1 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Urb2E9Q7L1 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Urb2E9Q7L1 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Urb2E9Q7L1 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Urb2E9Q7L1 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Urb2E9Q7L1 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Urb2E9Q7L1 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Urb2E9Q7L1 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Urb2E9Q7L1 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Urb2E9Q7L1 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms