Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Ccdc71lE9Q4T4 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Ccdc71lE9Q4T4 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Ccdc71lE9Q4T4 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms