Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms