Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6W3

Rdh8, Retinol dehydrogenase 8, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh8D3Z6W3 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh8D3Z6W3 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh8D3Z6W3 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh8D3Z6W3 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh8D3Z6W3 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh8D3Z6W3 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh8D3Z6W3 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh8D3Z6W3 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh8D3Z6W3 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh8D3Z6W3 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh8D3Z6W3 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh8D3Z6W3 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh8D3Z6W3 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh8D3Z6W3 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh8D3Z6W3 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh8D3Z6W3 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh8D3Z6W3 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh8D3Z6W3 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rdh8D3Z6W3 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms