Protein–RNA interactions for Protein: D3YVI9

Trim30c, Tripartite motif-containing 30C, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30cD3YVI9 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms