Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Clip3B9EHT4 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Clip3B9EHT4 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Clip3B9EHT4 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Clip3B9EHT4 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Clip3B9EHT4 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Clip3B9EHT4 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Clip3B9EHT4 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Clip3B9EHT4 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Clip3B9EHT4 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Clip3B9EHT4 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Clip3B9EHT4 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clip3B9EHT4 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clip3B9EHT4 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clip3B9EHT4 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clip3B9EHT4 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clip3B9EHT4 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clip3B9EHT4 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clip3B9EHT4 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clip3B9EHT4 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clip3B9EHT4 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clip3B9EHT4 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clip3B9EHT4 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clip3B9EHT4 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clip3B9EHT4 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clip3B9EHT4 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clip3B9EHT4 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clip3B9EHT4 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Clip3B9EHT4 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clip3B9EHT4 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clip3B9EHT4 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clip3B9EHT4 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clip3B9EHT4 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clip3B9EHT4 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clip3B9EHT4 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clip3B9EHT4 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clip3B9EHT4 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clip3B9EHT4 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clip3B9EHT4 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clip3B9EHT4 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clip3B9EHT4 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clip3B9EHT4 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clip3B9EHT4 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clip3B9EHT4 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clip3B9EHT4 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clip3B9EHT4 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Clip3B9EHT4 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Clip3B9EHT4 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Clip3B9EHT4 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Clip3B9EHT4 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Clip3B9EHT4 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Clip3B9EHT4 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Clip3B9EHT4 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Clip3B9EHT4 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Clip3B9EHT4 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Clip3B9EHT4 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Clip3B9EHT4 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Clip3B9EHT4 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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