Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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PtprbB2RU80 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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PtprbB2RU80 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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PtprbB2RU80 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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PtprbB2RU80 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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PtprbB2RU80 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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PtprbB2RU80 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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PtprbB2RU80 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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PtprbB2RU80 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PtprbB2RU80 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
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