Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prrt4B2RU40 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms