Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU8

Zbed5, MCG130675, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed5B2RPU8 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zbed5B2RPU8 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zbed5B2RPU8 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zbed5B2RPU8 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zbed5B2RPU8 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Zbed5B2RPU8 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zbed5B2RPU8 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zbed5B2RPU8 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zbed5B2RPU8 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zbed5B2RPU8 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zbed5B2RPU8 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zbed5B2RPU8 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Zbed5B2RPU8 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Zbed5B2RPU8 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zbed5B2RPU8 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zbed5B2RPU8 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zbed5B2RPU8 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Zbed5B2RPU8 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Zbed5B2RPU8 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zbed5B2RPU8 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zbed5B2RPU8 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Zbed5B2RPU8 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zbed5B2RPU8 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zbed5B2RPU8 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zbed5B2RPU8 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zbed5B2RPU8 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zbed5B2RPU8 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zbed5B2RPU8 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zbed5B2RPU8 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zbed5B2RPU8 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zbed5B2RPU8 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zbed5B2RPU8 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zbed5B2RPU8 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Zbed5B2RPU8 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Zbed5B2RPU8 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Zbed5B2RPU8 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Zbed5B2RPU8 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Zbed5B2RPU8 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Zbed5B2RPU8 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Zbed5B2RPU8 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Zbed5B2RPU8 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Zbed5B2RPU8 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Zbed5B2RPU8 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Zbed5B2RPU8 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Zbed5B2RPU8 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Zbed5B2RPU8 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Zbed5B2RPU8 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Zbed5B2RPU8 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Zbed5B2RPU8 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Zbed5B2RPU8 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Zbed5B2RPU8 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Zbed5B2RPU8 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Zbed5B2RPU8 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Zbed5B2RPU8 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Zbed5B2RPU8 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Zbed5B2RPU8 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Zbed5B2RPU8 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Zbed5B2RPU8 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Zbed5B2RPU8 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Zbed5B2RPU8 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Zbed5B2RPU8 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Zbed5B2RPU8 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Zbed5B2RPU8 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Zbed5B2RPU8 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Zbed5B2RPU8 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Zbed5B2RPU8 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Zbed5B2RPU8 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Zbed5B2RPU8 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Zbed5B2RPU8 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Zbed5B2RPU8 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Zbed5B2RPU8 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Zbed5B2RPU8 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Zbed5B2RPU8 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Zbed5B2RPU8 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Zbed5B2RPU8 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Zbed5B2RPU8 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Zbed5B2RPU8 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Zbed5B2RPU8 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Zbed5B2RPU8 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Zbed5B2RPU8 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Zbed5B2RPU8 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Zbed5B2RPU8 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Zbed5B2RPU8 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Zbed5B2RPU8 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Zbed5B2RPU8 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Zbed5B2RPU8 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Zbed5B2RPU8 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Zbed5B2RPU8 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Zbed5B2RPU8 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Zbed5B2RPU8 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Zbed5B2RPU8 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Zbed5B2RPU8 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Zbed5B2RPU8 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Zbed5B2RPU8 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Zbed5B2RPU8 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Zbed5B2RPU8 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Zbed5B2RPU8 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Zbed5B2RPU8 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Zbed5B2RPU8 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Zbed5B2RPU8 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
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