Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms