Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms